平成28年度末時点で所在不明とされていた164件のうち，その後所在が確認できた3件は以下のとおり。
※カッコ内の都県名は，所在不明となる前の所在地。
- （1）【重要文化財・彫刻】木造大日如来坐像（大阪府）
- （2）【重要文化財・彫刻】木造御神像
倭迹々 日百襲姫 命 坐像 （香川県） - （3）【重要文化財・工芸品】刀（東京都）
≪所在確認できた主な経緯≫
- （1）:盗難文化財であったが，情報提供により警察に確保された。
- （2）:現所有者が所有者変更の手続きについて文化庁に相談があり，現物確認等を行った。
- （3）:現所有者が所有者変更の届出を提出してきたため。
